Кирито, Юджио и Алиса. Прошло полгода с того дня, когда два элитных курсанта и один рыцарь единства одолели Первосвященницу Администратор. После битвы Алиса вернулась на родину, в деревню Рулид. Под одной с ней крышей живёт Кирито, потерявший лучшего друга, руку и душу. Алиса самоотверженно ухаживает за ним, но в ней больше не осталось рыцарской решимости. — Скажи, Кирито... Что мне делать? Тем временем неумолимо истекает время до фазы окончательного стресс-теста, который грозит всему Андерворлду ужасным катаклизмом. В преддверии трагедии в глубине Дарк Территори возвращается на престол бог тьмы Вектор. Он встаёт во главе армии тьмы и начинает наступление на мир людей, чтобы пленить некую жрицу света. Командир рыцарей единства Беркули, возглавивший оборону мира людей, решает сразиться с армией Дарк Территори в битве доселе неслыханных масштабов. Но пока что рядом с ним нет ни Алисы, ни двух героев, недавно спасших Андерворлд. Грядёт самая длинная и самая прекрасная битва Sword Art Online. Настало время завершить цикл «Алисизация»!

Несмотря на талант влипать в неприятности, связанные с виртуальными мирами, Кирито упорно старается быть в курсе развития VR-технологий, так как видит в них будущее. Загадочная фирма RATH, куда Кирито устроился на подработку и где надо всего-то спать и видеть виртуальные сны (о которых он правда при пробуждении ничего не помнит). Сны, основанные на принципиально иной технологии создания виртуальных миров, нежели Амусфера. Словно играя в бога, RATH пытается заглянуть в саму суть человека - в его душу, в самом прямом смысле слова. И Кирито, снова став жертвой обстоятельств, в новом по-настоящему жестоком виртуальном мире, где всё же быстро обретает нового друга, бросает вызов тем тайнам, что встают перед ним.